windows 2000 server 不能和linux 共处？（硬盘问题）

leaner

我在我的爱机装windows 2000 和linux
不久前改变了这个硬盘的分区
把所有的分区都删除了
再装了windows 2000 server
接着用分区魔法师分区
分区过程没有什么问题
紧接着装linux
但是用fdisk的时候就发现问题了
问题大概是这样的 例如 我的hda1 的柱面1－255
hda2 是256－500吧 但是选择挂载点的时候就发现255－255 是free的 大小是0 M（可以理解）
我用lilo引导
装完linux后启动windows的时候就有问题了
  每次启动都有一个黑屏幕（和不正常关机时很象）说是发现xxxx（一段长长的数字） 格式是fat32
也有别的 windows不能识别（估计是EXT2了）
还建议扫描（scan） 但是，我只能按任意键取消，因为要结束的时候 我的键盘没反应了
好久回系统自己跳过 继续启动 到了正常的系统要弹出窗口输入用户名和密码的那一部却出奇的久
（起码要等5分钟才出现）
进去以后 凡是与磁盘有关的程序几乎都不能用了（比如 碎片整理 磁盘管理）
  各位兄弟，请教怎么回事。


（补充一下 我后来用红旗2.0的安装盘的Fdisk 删除了c盘 再装还是一样。 我以前装 2000专业版的时候怎么分都是好的。 再后来，几乎删除了所有分区再装2000 server（问题消除），接着再用红旗2.0的安装盘的Fdisk划分出几个EXT2分区 再进入windows的时候问题又来了）
  我的疑惑是 红旗2.0的Fdisk 不行呢 还是windows 2000 server和linux不能很好的相处（问题来的时候，就是专业版的碎片整理 磁盘管理也不能用了）